Protein–RNA interactions for Protein: P01755

Ig heavy chain V region S43, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01755 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01755 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01755 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01755 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01755 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01755 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01755 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01755 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01755 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01755 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01755 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01755 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01755 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01755 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01755 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01755 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01755 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01755 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01755 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01755 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01755 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01755 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01755 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P01755 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01755 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01755 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01755 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P01755 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01755 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
P01755 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01755 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01755 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01755 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01755 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01755 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01755 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01755 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01755 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01755 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01755 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01755 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01755 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01755 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01755 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01755 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01755 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01755 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01755 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01755 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01755 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01755 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01755 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01755 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01755 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01755 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01755 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01755 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01755 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01755 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01755 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01755 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01755 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01755 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01755 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01755 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01755 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01755 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01755 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01755 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01755 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P01755 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01755 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01755 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01755 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01755 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01755 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms