Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01747 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01747 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01747 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01747 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01747 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01747 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01747 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01747 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01747 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01747 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01747 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01747 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01747 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01747 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01747 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01747 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01747 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01747 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01747 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01747 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01747 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01747 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01747 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01747 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01747 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01747 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01747 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01747 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01747 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
P01747 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01747 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01747 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01747 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01747 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01747 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01747 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01747 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01747 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01747 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01747 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01747 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01747 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01747 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01747 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01747 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01747 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01747 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01747 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01747 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01747 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01747 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01747 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01747 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01747 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01747 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01747 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01747 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01747 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01747 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01747 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01747 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
P01747 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
P01747 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
P01747 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
P01747 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01747 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01747 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01747 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
P01747 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms