Protein–RNA interactions for Protein: P01630

Ig kappa chain V-II region 7S34.1, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01630 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01630 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01630 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01630 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01630 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
P01630 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01630 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01630 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01630 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01630 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
P01630 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01630 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01630 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01630 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01630 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01630 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
P01630 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
P01630 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
P01630 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
P01630 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01630 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01630 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01630 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01630 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
P01630 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01630 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01630 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
P01630 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01630 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
P01630 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01630 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
P01630 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
P01630 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
P01630 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01630 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01630 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01630 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
P01630 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01630 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01630 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
P01630 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01630 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01630 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01630 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
P01630 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
P01630 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
P01630 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01630 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
P01630 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01630 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
P01630 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
P01630 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01630 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
P01630 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
P01630 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01630 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01630 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
P01630 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
P01630 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
P01630 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
P01630 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01630 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
P01630 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P01630 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
P01630 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
P01630 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
P01630 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
P01630 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
P01630 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01630 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01630 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01630 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01630 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
P01630 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
P01630 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
P01630 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P01630 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
P01630 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P01630 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P01630 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
P01630 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
P01630 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P01630 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
P01630 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P01630 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
P01630 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
P01630 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01630 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
P01630 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P01630 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P01630 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
P01630 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P01630 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P01630 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
P01630 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms