Protein–RNA interactions for Protein: P01036

CST4, Cystatin-S, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST4P01036 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CST4P01036 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST4P01036 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST4P01036 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CST4P01036 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST4P01036 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST4P01036 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CST4P01036 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CST4P01036 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST4P01036 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CST4P01036 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST4P01036 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST4P01036 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST4P01036 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CST4P01036 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CST4P01036 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CST4P01036 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CST4P01036 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST4P01036 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST4P01036 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CST4P01036 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CST4P01036 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST4P01036 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CST4P01036 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST4P01036 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CST4P01036 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CST4P01036 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST4P01036 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST4P01036 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CST4P01036 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CST4P01036 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CST4P01036 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST4P01036 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CST4P01036 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST4P01036 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CST4P01036 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST4P01036 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CST4P01036 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST4P01036 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST4P01036 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CST4P01036 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST4P01036 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST4P01036 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CST4P01036 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CST4P01036 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CST4P01036 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CST4P01036 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CST4P01036 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CST4P01036 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CST4P01036 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CST4P01036 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST4P01036 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CST4P01036 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST4P01036 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CST4P01036 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST4P01036 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST4P01036 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CST4P01036 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST4P01036 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CST4P01036 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CST4P01036 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST4P01036 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST4P01036 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CST4P01036 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CST4P01036 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CST4P01036 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST4P01036 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST4P01036 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST4P01036 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST4P01036 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CST4P01036 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CST4P01036 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST4P01036 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CST4P01036 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST4P01036 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST4P01036 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST4P01036 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST4P01036 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CST4P01036 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST4P01036 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST4P01036 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CST4P01036 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms