Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1RP00736 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
C1RP00736 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
C1RP00736 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
C1RP00736 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
C1RP00736 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1RP00736 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1RP00736 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
C1RP00736 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C1RP00736 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
C1RP00736 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
C1RP00736 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
C1RP00736 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
C1RP00736 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
C1RP00736 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
C1RP00736 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
C1RP00736 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
C1RP00736 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
C1RP00736 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1RP00736 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1RP00736 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1RP00736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
C1RP00736 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
C1RP00736 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1RP00736 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
C1RP00736 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1RP00736 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
C1RP00736 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1RP00736 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1RP00736 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1RP00736 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
C1RP00736 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1RP00736 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1RP00736 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1RP00736 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
C1RP00736 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1RP00736 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1RP00736 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1RP00736 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
C1RP00736 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1RP00736 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1RP00736 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1RP00736 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1RP00736 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
C1RP00736 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1RP00736 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1RP00736 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
C1RP00736 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
C1RP00736 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
C1RP00736 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
C1RP00736 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1RP00736 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1RP00736 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
C1RP00736 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1RP00736 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1RP00736 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
C1RP00736 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1RP00736 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1RP00736 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
C1RP00736 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
C1RP00736 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1RP00736 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1RP00736 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
C1RP00736 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1RP00736 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
C1RP00736 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1RP00736 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
C1RP00736 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
C1RP00736 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1RP00736 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1RP00736 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
C1RP00736 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1RP00736 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1RP00736 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
C1RP00736 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1RP00736 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1RP00736 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1RP00736 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1RP00736 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
C1RP00736 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
C1RP00736 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
C1RP00736 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1RP00736 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
C1RP00736 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms