Protein–RNA interactions for Protein: O95674

CDS2, Phosphatidate cytidylyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDS2O95674 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDS2O95674 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDS2O95674 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDS2O95674 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDS2O95674 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CDS2O95674 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDS2O95674 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDS2O95674 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CDS2O95674 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDS2O95674 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDS2O95674 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDS2O95674 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CDS2O95674 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDS2O95674 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDS2O95674 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDS2O95674 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDS2O95674 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CDS2O95674 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDS2O95674 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDS2O95674 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CDS2O95674 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDS2O95674 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CDS2O95674 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDS2O95674 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CDS2O95674 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDS2O95674 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDS2O95674 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CDS2O95674 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDS2O95674 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDS2O95674 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDS2O95674 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CDS2O95674 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDS2O95674 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDS2O95674 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDS2O95674 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CDS2O95674 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDS2O95674 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDS2O95674 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDS2O95674 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDS2O95674 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDS2O95674 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDS2O95674 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDS2O95674 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDS2O95674 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDS2O95674 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDS2O95674 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDS2O95674 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDS2O95674 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS2O95674 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDS2O95674 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS2O95674 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS2O95674 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDS2O95674 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS2O95674 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS2O95674 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDS2O95674 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDS2O95674 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS2O95674 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS2O95674 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDS2O95674 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDS2O95674 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDS2O95674 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS2O95674 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS2O95674 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDS2O95674 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS2O95674 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDS2O95674 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS2O95674 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CDS2O95674 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CDS2O95674 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS2O95674 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CDS2O95674 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CDS2O95674 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CDS2O95674 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS2O95674 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS2O95674 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS2O95674 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CDS2O95674 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CDS2O95674 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CDS2O95674 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDS2O95674 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDS2O95674 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CDS2O95674 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CDS2O95674 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDS2O95674 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CDS2O95674 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDS2O95674 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDS2O95674 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms