Protein–RNA interactions for Protein: O95197

RTN3, Reticulon-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN3O95197 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN3O95197 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN3O95197 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN3O95197 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN3O95197 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN3O95197 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN3O95197 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN3O95197 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN3O95197 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN3O95197 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN3O95197 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN3O95197 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN3O95197 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN3O95197 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN3O95197 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN3O95197 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN3O95197 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN3O95197 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN3O95197 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RTN3O95197 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN3O95197 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN3O95197 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN3O95197 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN3O95197 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN3O95197 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN3O95197 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN3O95197 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN3O95197 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN3O95197 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN3O95197 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN3O95197 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN3O95197 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN3O95197 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN3O95197 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN3O95197 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN3O95197 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN3O95197 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN3O95197 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN3O95197 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN3O95197 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN3O95197 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN3O95197 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RTN3O95197 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN3O95197 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN3O95197 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RTN3O95197 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RTN3O95197 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN3O95197 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RTN3O95197 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN3O95197 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN3O95197 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RTN3O95197 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
RTN3O95197 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN3O95197 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN3O95197 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RTN3O95197 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN3O95197 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RTN3O95197 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
RTN3O95197 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RTN3O95197 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RTN3O95197 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RTN3O95197 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN3O95197 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
RTN3O95197 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RTN3O95197 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN3O95197 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RTN3O95197 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN3O95197 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN3O95197 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN3O95197 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RTN3O95197 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN3O95197 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RTN3O95197 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RTN3O95197 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RTN3O95197 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN3O95197 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
RTN3O95197 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN3O95197 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN3O95197 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN3O95197 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RTN3O95197 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RTN3O95197 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN3O95197 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RTN3O95197 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN3O95197 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN3O95197 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN3O95197 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN3O95197 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RTN3O95197 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN3O95197 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RTN3O95197 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RTN3O95197 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
RTN3O95197 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN3O95197 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RTN3O95197 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms