Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG12O94817 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ATG12O94817 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ATG12O94817 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG12O94817 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG12O94817 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG12O94817 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ATG12O94817 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ATG12O94817 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG12O94817 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG12O94817 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG12O94817 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ATG12O94817 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ATG12O94817 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG12O94817 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG12O94817 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG12O94817 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG12O94817 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG12O94817 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ATG12O94817 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG12O94817 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG12O94817 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG12O94817 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ATG12O94817 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG12O94817 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG12O94817 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG12O94817 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ATG12O94817 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG12O94817 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG12O94817 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ATG12O94817 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG12O94817 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG12O94817 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG12O94817 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG12O94817 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ATG12O94817 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG12O94817 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG12O94817 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG12O94817 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG12O94817 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ATG12O94817 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG12O94817 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG12O94817 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ATG12O94817 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG12O94817 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG12O94817 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ATG12O94817 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG12O94817 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG12O94817 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG12O94817 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ATG12O94817 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG12O94817 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ATG12O94817 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG12O94817 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG12O94817 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG12O94817 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATG12O94817 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG12O94817 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATG12O94817 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG12O94817 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATG12O94817 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATG12O94817 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATG12O94817 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATG12O94817 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG12O94817 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG12O94817 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG12O94817 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG12O94817 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATG12O94817 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATG12O94817 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG12O94817 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATG12O94817 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATG12O94817 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG12O94817 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG12O94817 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms