Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
CNTN5O94779 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CNTN5O94779 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CNTN5O94779 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CNTN5O94779 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CNTN5O94779 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CNTN5O94779 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CNTN5O94779 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.1 ms