Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lrrc6O88978 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lrrc6O88978 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrc6O88978 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrc6O88978 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrc6O88978 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrc6O88978 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrc6O88978 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms