Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf106O88466 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Znf106O88466 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf106O88466 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf106O88466 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Znf106O88466 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf106O88466 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf106O88466 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Znf106O88466 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Znf106O88466 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Znf106O88466 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf106O88466 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf106O88466 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf106O88466 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Znf106O88466 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf106O88466 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf106O88466 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf106O88466 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Znf106O88466 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf106O88466 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Znf106O88466 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Znf106O88466 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms