Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col5a1O88207 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col5a1O88207 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col5a1O88207 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col5a1O88207 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Col5a1O88207 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Col5a1O88207 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Col5a1O88207 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Col5a1O88207 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms