Protein–RNA interactions for Protein: O76038

SCGN, Secretagogin, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGNO76038 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCGNO76038 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCGNO76038 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCGNO76038 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGNO76038 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCGNO76038 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGNO76038 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGNO76038 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCGNO76038 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGNO76038 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCGNO76038 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGNO76038 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGNO76038 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGNO76038 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGNO76038 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCGNO76038 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGNO76038 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCGNO76038 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCGNO76038 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCGNO76038 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGNO76038 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGNO76038 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGNO76038 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCGNO76038 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCGNO76038 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGNO76038 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SCGNO76038 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGNO76038 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCGNO76038 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGNO76038 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGNO76038 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGNO76038 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGNO76038 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCGNO76038 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGNO76038 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCGNO76038 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGNO76038 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SCGNO76038 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGNO76038 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGNO76038 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGNO76038 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCGNO76038 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGNO76038 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SCGNO76038 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SCGNO76038 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGNO76038 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGNO76038 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SCGNO76038 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SCGNO76038 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGNO76038 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGNO76038 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SCGNO76038 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGNO76038 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCGNO76038 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCGNO76038 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGNO76038 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGNO76038 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGNO76038 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCGNO76038 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCGNO76038 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGNO76038 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGNO76038 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGNO76038 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCGNO76038 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGNO76038 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCGNO76038 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGNO76038 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGNO76038 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGNO76038 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGNO76038 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCGNO76038 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGNO76038 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCGNO76038 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGNO76038 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGNO76038 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGNO76038 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCGNO76038 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGNO76038 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGNO76038 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCGNO76038 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGNO76038 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGNO76038 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCGNO76038 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCGNO76038 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCGNO76038 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGNO76038 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGNO76038 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SCGNO76038 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms