Protein–RNA interactions for Protein: O76011

KRT34, Keratin, type I cuticular Ha4, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT34O76011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT34O76011 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT34O76011 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT34O76011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT34O76011 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT34O76011 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT34O76011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT34O76011 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT34O76011 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT34O76011 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT34O76011 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT34O76011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT34O76011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT34O76011 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT34O76011 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT34O76011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT34O76011 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT34O76011 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT34O76011 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT34O76011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT34O76011 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT34O76011 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT34O76011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT34O76011 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT34O76011 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT34O76011 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT34O76011 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT34O76011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT34O76011 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT34O76011 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT34O76011 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT34O76011 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT34O76011 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT34O76011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT34O76011 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT34O76011 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT34O76011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT34O76011 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT34O76011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT34O76011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT34O76011 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT34O76011 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT34O76011 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT34O76011 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT34O76011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT34O76011 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT34O76011 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT34O76011 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT34O76011 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KRT34O76011 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT34O76011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT34O76011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT34O76011 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KRT34O76011 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT34O76011 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT34O76011 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT34O76011 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KRT34O76011 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT34O76011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KRT34O76011 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KRT34O76011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT34O76011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT34O76011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KRT34O76011 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
KRT34O76011 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT34O76011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KRT34O76011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT34O76011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT34O76011 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KRT34O76011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT34O76011 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
KRT34O76011 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT34O76011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT34O76011 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KRT34O76011 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT34O76011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT34O76011 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KRT34O76011 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT34O76011 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT34O76011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT34O76011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT34O76011 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KRT34O76011 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT34O76011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT34O76011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRT34O76011 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KRT34O76011 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT34O76011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT34O76011 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
KRT34O76011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms