Protein–RNA interactions for Protein: O75676

RPS6KA4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA4O75676 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
RPS6KA4O75676 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
RPS6KA4O75676 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RPS6KA4O75676 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
RPS6KA4O75676 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
RPS6KA4O75676 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
RPS6KA4O75676 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
RPS6KA4O75676 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RPS6KA4O75676 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
RPS6KA4O75676 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
RPS6KA4O75676 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms