Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM3O75382 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM3O75382 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM3O75382 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM3O75382 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TRIM3O75382 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TRIM3O75382 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms