Protein–RNA interactions for Protein: O75298

RTN2, Reticulon-2, humanhuman

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN2O75298 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN2O75298 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RTN2O75298 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN2O75298 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RTN2O75298 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RTN2O75298 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN2O75298 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RTN2O75298 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RTN2O75298 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN2O75298 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RTN2O75298 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN2O75298 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN2O75298 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN2O75298 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN2O75298 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RTN2O75298 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN2O75298 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN2O75298 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RTN2O75298 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN2O75298 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN2O75298 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN2O75298 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN2O75298 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RTN2O75298 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN2O75298 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN2O75298 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN2O75298 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN2O75298 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN2O75298 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN2O75298 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN2O75298 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN2O75298 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN2O75298 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN2O75298 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN2O75298 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN2O75298 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN2O75298 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN2O75298 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN2O75298 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN2O75298 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN2O75298 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN2O75298 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN2O75298 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN2O75298 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RTN2O75298 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN2O75298 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN2O75298 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN2O75298 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN2O75298 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN2O75298 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN2O75298 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN2O75298 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN2O75298 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN2O75298 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN2O75298 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN2O75298 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN2O75298 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN2O75298 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN2O75298 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN2O75298 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN2O75298 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RTN2O75298 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN2O75298 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN2O75298 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RTN2O75298 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN2O75298 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
RTN2O75298 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN2O75298 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN2O75298 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN2O75298 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RTN2O75298 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RTN2O75298 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN2O75298 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN2O75298 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN2O75298 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RTN2O75298 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RTN2O75298 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN2O75298 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN2O75298 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RTN2O75298 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RTN2O75298 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RTN2O75298 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RTN2O75298 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
RTN2O75298 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RTN2O75298 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN2O75298 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN2O75298 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN2O75298 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN2O75298 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RTN2O75298 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN2O75298 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN2O75298 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN2O75298 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN2O75298 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RTN2O75298 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms