Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COQ9O75208 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ9O75208 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ9O75208 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ9O75208 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
COQ9O75208 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
COQ9O75208 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ9O75208 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ9O75208 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
COQ9O75208 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
COQ9O75208 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ9O75208 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ9O75208 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
COQ9O75208 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ9O75208 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ9O75208 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ9O75208 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
COQ9O75208 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ9O75208 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ9O75208 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
COQ9O75208 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COQ9O75208 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
COQ9O75208 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COQ9O75208 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
COQ9O75208 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ9O75208 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ9O75208 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ9O75208 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ9O75208 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
COQ9O75208 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
COQ9O75208 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ9O75208 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ9O75208 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ9O75208 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ9O75208 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COQ9O75208 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ9O75208 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ9O75208 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ9O75208 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ9O75208 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COQ9O75208 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ9O75208 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COQ9O75208 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COQ9O75208 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COQ9O75208 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COQ9O75208 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ9O75208 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ9O75208 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COQ9O75208 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ9O75208 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ9O75208 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ9O75208 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
COQ9O75208 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
COQ9O75208 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COQ9O75208 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ9O75208 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ9O75208 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ9O75208 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COQ9O75208 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ9O75208 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ9O75208 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ9O75208 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ9O75208 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COQ9O75208 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ9O75208 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ9O75208 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COQ9O75208 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ9O75208 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ9O75208 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ9O75208 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COQ9O75208 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ9O75208 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
COQ9O75208 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ9O75208 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ9O75208 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ9O75208 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ9O75208 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COQ9O75208 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
COQ9O75208 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms