Protein–RNA interactions for Protein: O75177

SS18L1, Calcium-responsive transactivator, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L1O75177 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SS18L1O75177 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SS18L1O75177 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SS18L1O75177 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SS18L1O75177 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SS18L1O75177 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SS18L1O75177 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms