Protein–RNA interactions for Protein: O75063

FAM20B, Glycosaminoglycan xylosylkinase, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20BO75063 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM20BO75063 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FAM20BO75063 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FAM20BO75063 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FAM20BO75063 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FAM20BO75063 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FAM20BO75063 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms