Protein–RNA interactions for Protein: O60678

PRMT3, Protein arginine N-methyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRMT3O60678 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PRMT3O60678 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRMT3O60678 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PRMT3O60678 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRMT3O60678 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PRMT3O60678 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PRMT3O60678 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms