Protein–RNA interactions for Protein: O60231

DHX16, Putative pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,041 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX16O60231 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
DHX16O60231 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DHX16O60231 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
DHX16O60231 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DHX16O60231 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DHX16O60231 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DHX16O60231 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
DHX16O60231 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
DHX16O60231 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DHX16O60231 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DHX16O60231 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
DHX16O60231 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
DHX16O60231 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DHX16O60231 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
DHX16O60231 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DHX16O60231 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DHX16O60231 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DHX16O60231 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
DHX16O60231 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
DHX16O60231 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DHX16O60231 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
DHX16O60231 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
DHX16O60231 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
DHX16O60231 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.53
DHX16O60231 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DHX16O60231 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DHX16O60231 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
DHX16O60231 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
DHX16O60231 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
DHX16O60231 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
DHX16O60231 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
DHX16O60231 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DHX16O60231 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
DHX16O60231 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
DHX16O60231 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
DHX16O60231 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
DHX16O60231 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DHX16O60231 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
DHX16O60231 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DHX16O60231 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DHX16O60231 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
DHX16O60231 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DHX16O60231 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
DHX16O60231 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DHX16O60231 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DHX16O60231 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
DHX16O60231 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
DHX16O60231 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
DHX16O60231 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
DHX16O60231 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
DHX16O60231 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DHX16O60231 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
DHX16O60231 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
DHX16O60231 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DHX16O60231 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
DHX16O60231 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DHX16O60231 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
DHX16O60231 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
DHX16O60231 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
DHX16O60231 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
DHX16O60231 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
DHX16O60231 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
DHX16O60231 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DHX16O60231 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DHX16O60231 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DHX16O60231 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
DHX16O60231 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
DHX16O60231 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DHX16O60231 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DHX16O60231 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
DHX16O60231 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
DHX16O60231 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
DHX16O60231 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
DHX16O60231 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
DHX16O60231 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
DHX16O60231 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DHX16O60231 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DHX16O60231 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
DHX16O60231 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DHX16O60231 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DHX16O60231 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
DHX16O60231 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms