Protein–RNA interactions for Protein: O54962

Banf1, Barrier-to-autointegration factor, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Banf1O54962 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Banf1O54962 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Banf1O54962 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Banf1O54962 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Banf1O54962 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Banf1O54962 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Banf1O54962 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Banf1O54962 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Banf1O54962 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Banf1O54962 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Banf1O54962 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Banf1O54962 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Banf1O54962 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Banf1O54962 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Banf1O54962 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Banf1O54962 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Banf1O54962 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Banf1O54962 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Banf1O54962 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Banf1O54962 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Banf1O54962 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms