Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NlkO54949 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NlkO54949 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NlkO54949 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NlkO54949 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NlkO54949 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NlkO54949 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NlkO54949 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NlkO54949 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NlkO54949 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NlkO54949 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NlkO54949 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NlkO54949 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NlkO54949 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NlkO54949 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NlkO54949 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NlkO54949 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NlkO54949 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NlkO54949 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NlkO54949 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NlkO54949 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NlkO54949 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NlkO54949 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NlkO54949 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NlkO54949 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NlkO54949 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NlkO54949 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NlkO54949 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NlkO54949 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NlkO54949 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NlkO54949 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NlkO54949 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NlkO54949 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NlkO54949 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NlkO54949 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NlkO54949 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NlkO54949 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NlkO54949 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NlkO54949 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NlkO54949 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NlkO54949 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NlkO54949 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NlkO54949 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NlkO54949 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NlkO54949 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NlkO54949 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NlkO54949 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NlkO54949 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NlkO54949 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NlkO54949 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
NlkO54949 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NlkO54949 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NlkO54949 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
NlkO54949 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
NlkO54949 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
NlkO54949 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
NlkO54949 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NlkO54949 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NlkO54949 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NlkO54949 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NlkO54949 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
NlkO54949 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NlkO54949 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NlkO54949 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NlkO54949 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NlkO54949 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NlkO54949 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NlkO54949 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NlkO54949 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NlkO54949 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NlkO54949 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NlkO54949 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NlkO54949 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NlkO54949 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NlkO54949 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NlkO54949 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NlkO54949 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms