Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DffaO54786 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DffaO54786 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DffaO54786 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DffaO54786 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DffaO54786 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
DffaO54786 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
DffaO54786 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DffaO54786 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
DffaO54786 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DffaO54786 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
DffaO54786 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DffaO54786 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
DffaO54786 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
DffaO54786 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
DffaO54786 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DffaO54786 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
DffaO54786 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
DffaO54786 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
DffaO54786 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
DffaO54786 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
DffaO54786 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DffaO54786 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DffaO54786 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
DffaO54786 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DffaO54786 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DffaO54786 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DffaO54786 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DffaO54786 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DffaO54786 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DffaO54786 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
DffaO54786 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DffaO54786 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DffaO54786 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DffaO54786 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DffaO54786 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
DffaO54786 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DffaO54786 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DffaO54786 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
DffaO54786 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DffaO54786 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DffaO54786 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DffaO54786 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DffaO54786 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DffaO54786 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DffaO54786 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DffaO54786 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DffaO54786 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DffaO54786 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DffaO54786 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DffaO54786 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DffaO54786 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DffaO54786 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
DffaO54786 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DffaO54786 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DffaO54786 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DffaO54786 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DffaO54786 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DffaO54786 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DffaO54786 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DffaO54786 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DffaO54786 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DffaO54786 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DffaO54786 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
DffaO54786 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DffaO54786 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DffaO54786 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DffaO54786 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DffaO54786 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DffaO54786 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DffaO54786 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DffaO54786 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DffaO54786 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DffaO54786 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DffaO54786 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DffaO54786 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DffaO54786 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DffaO54786 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DffaO54786 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DffaO54786 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DffaO54786 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DffaO54786 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
DffaO54786 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
DffaO54786 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
DffaO54786 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DffaO54786 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
DffaO54786 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
DffaO54786 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DffaO54786 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
DffaO54786 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
DffaO54786 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DffaO54786 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
DffaO54786 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DffaO54786 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
DffaO54786 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
DffaO54786 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
DffaO54786 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DffaO54786 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
DffaO54786 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
DffaO54786 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms