Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CrxO54751 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrxO54751 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CrxO54751 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrxO54751 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CrxO54751 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrxO54751 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrxO54751 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrxO54751 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CrxO54751 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CrxO54751 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CrxO54751 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CrxO54751 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
CrxO54751 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
CrxO54751 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrxO54751 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrxO54751 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CrxO54751 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrxO54751 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrxO54751 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CrxO54751 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CrxO54751 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrxO54751 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrxO54751 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrxO54751 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrxO54751 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CrxO54751 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CrxO54751 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CrxO54751 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CrxO54751 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CrxO54751 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CrxO54751 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CrxO54751 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CrxO54751 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxO54751 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxO54751 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxO54751 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxO54751 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CrxO54751 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxO54751 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxO54751 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxO54751 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxO54751 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CrxO54751 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxO54751 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxO54751 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxO54751 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CrxO54751 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxO54751 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxO54751 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxO54751 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CrxO54751 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxO54751 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CrxO54751 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CrxO54751 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CrxO54751 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxO54751 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxO54751 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxO54751 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxO54751 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CrxO54751 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrxO54751 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrxO54751 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CrxO54751 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrxO54751 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrxO54751 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrxO54751 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CrxO54751 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrxO54751 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrxO54751 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CrxO54751 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CrxO54751 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrxO54751 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CrxO54751 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrxO54751 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrxO54751 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrxO54751 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrxO54751 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrxO54751 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
CrxO54751 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
CrxO54751 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms