Protein–RNA interactions for Protein: O54724

Cavin1, Caveolae-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin1O54724 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cavin1O54724 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cavin1O54724 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cavin1O54724 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cavin1O54724 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cavin1O54724 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cavin1O54724 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Cavin1O54724 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cavin1O54724 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms