Protein–RNA interactions for Protein: O43657

TSPAN6, Tetraspanin-6, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN6O43657 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TSPAN6O43657 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TSPAN6O43657 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TSPAN6O43657 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TSPAN6O43657 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TSPAN6O43657 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TSPAN6O43657 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TSPAN6O43657 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms