Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
HOXA3O43365 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA3O43365 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HOXA3O43365 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
HOXA3O43365 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
HOXA3O43365 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms