Protein–RNA interactions for Protein: O43325

LYRM1, LYR motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYRM1O43325 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LYRM1O43325 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LYRM1O43325 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LYRM1O43325 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LYRM1O43325 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LYRM1O43325 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LYRM1O43325 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LYRM1O43325 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms