Protein–RNA interactions for Protein: O43307

ARHGEF9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF9O43307 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ARHGEF9O43307 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ARHGEF9O43307 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ARHGEF9O43307 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ARHGEF9O43307 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ARHGEF9O43307 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ARHGEF9O43307 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms