Protein–RNA interactions for Protein: O35690

Phox2b, Paired mesoderm homeobox protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2bO35690 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Phox2bO35690 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Phox2bO35690 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Phox2bO35690 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Phox2bO35690 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Phox2bO35690 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Phox2bO35690 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Phox2bO35690 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms