Protein–RNA interactions for Protein: O35491

Clk2, Dual specificity protein kinase CLK2, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk2O35491 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Clk2O35491 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clk2O35491 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Clk2O35491 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clk2O35491 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Clk2O35491 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clk2O35491 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
Clk2O35491 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clk2O35491 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Clk2O35491 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clk2O35491 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clk2O35491 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clk2O35491 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clk2O35491 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clk2O35491 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Clk2O35491 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clk2O35491 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clk2O35491 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.2 ms