Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2-ObO35424 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2-ObO35424 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
H2-ObO35424 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
H2-ObO35424 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
H2-ObO35424 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
H2-ObO35424 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123 ms