Protein–RNA interactions for Protein: O15553

MEFV, Pyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEFVO15553 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEFVO15553 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEFVO15553 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
MEFVO15553 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
MEFVO15553 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
MEFVO15553 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEFVO15553 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEFVO15553 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
MEFVO15553 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEFVO15553 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
MEFVO15553 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
MEFVO15553 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEFVO15553 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
MEFVO15553 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEFVO15553 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
MEFVO15553 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEFVO15553 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
MEFVO15553 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEFVO15553 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEFVO15553 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEFVO15553 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEFVO15553 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
MEFVO15553 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEFVO15553 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEFVO15553 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEFVO15553 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEFVO15553 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
MEFVO15553 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEFVO15553 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEFVO15553 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
MEFVO15553 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
MEFVO15553 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
MEFVO15553 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
MEFVO15553 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
MEFVO15553 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEFVO15553 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEFVO15553 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
MEFVO15553 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEFVO15553 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
MEFVO15553 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
MEFVO15553 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEFVO15553 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEFVO15553 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEFVO15553 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
MEFVO15553 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEFVO15553 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
MEFVO15553 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
MEFVO15553 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
MEFVO15553 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEFVO15553 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEFVO15553 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEFVO15553 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
MEFVO15553 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEFVO15553 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
MEFVO15553 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEFVO15553 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
MEFVO15553 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
MEFVO15553 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MEFVO15553 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MEFVO15553 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
MEFVO15553 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEFVO15553 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEFVO15553 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MEFVO15553 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEFVO15553 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MEFVO15553 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
MEFVO15553 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEFVO15553 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MEFVO15553 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEFVO15553 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEFVO15553 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEFVO15553 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MEFVO15553 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
MEFVO15553 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEFVO15553 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
MEFVO15553 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MEFVO15553 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MEFVO15553 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEFVO15553 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEFVO15553 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MEFVO15553 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MEFVO15553 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEFVO15553 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MEFVO15553 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
MEFVO15553 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms