Protein–RNA interactions for Protein: O15439

ABCC4, Multidrug resistance-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC4O15439 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.8■■■■□ 3
ABCC4O15439 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC4O15439 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC4O15439 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC4O15439 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC4O15439 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ABCC4O15439 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC4O15439 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ABCC4O15439 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC4O15439 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ABCC4O15439 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
ABCC4O15439 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ABCC4O15439 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
ABCC4O15439 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ABCC4O15439 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ABCC4O15439 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ABCC4O15439 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC4O15439 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ABCC4O15439 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms