Protein–RNA interactions for Protein: O15195

VILL, Villin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VILLO15195 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
VILLO15195 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
VILLO15195 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
VILLO15195 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
VILLO15195 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
VILLO15195 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
VILLO15195 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
VILLO15195 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
VILLO15195 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
VILLO15195 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VILLO15195 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
VILLO15195 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
VILLO15195 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
VILLO15195 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
VILLO15195 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VILLO15195 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
VILLO15195 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
VILLO15195 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
VILLO15195 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
VILLO15195 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
VILLO15195 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
VILLO15195 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
VILLO15195 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
VILLO15195 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
VILLO15195 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
VILLO15195 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
VILLO15195 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
VILLO15195 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
VILLO15195 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.21■■□□□ 1.79
VILLO15195 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
VILLO15195 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
VILLO15195 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
VILLO15195 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
VILLO15195 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
VILLO15195 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
VILLO15195 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
VILLO15195 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
VILLO15195 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VILLO15195 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VILLO15195 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VILLO15195 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VILLO15195 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VILLO15195 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.3 ms