Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
POLR1CO15160 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1CO15160 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLR1CO15160 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
POLR1CO15160 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR1CO15160 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR1CO15160 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms