Protein–RNA interactions for Protein: O15075

DCLK1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLK1O15075 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.39■■□□□ 1.98
DCLK1O15075 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
DCLK1O15075 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
DCLK1O15075 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
DCLK1O15075 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DCLK1O15075 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
DCLK1O15075 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms