Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
IKBKBO14920 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
IKBKBO14920 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
IKBKBO14920 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IKBKBO14920 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
IKBKBO14920 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
IKBKBO14920 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
IKBKBO14920 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms