Protein–RNA interactions for Protein: O14910

LIN7A, Protein lin-7 homolog A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN7AO14910 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LIN7AO14910 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LIN7AO14910 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LIN7AO14910 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LIN7AO14910 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LIN7AO14910 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LIN7AO14910 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms