Protein–RNA interactions for Protein: O14894

TM4SF5, Transmembrane 4 L6 family member 5, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF5O14894 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TM4SF5O14894 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TM4SF5O14894 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TM4SF5O14894 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TM4SF5O14894 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TM4SF5O14894 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
TM4SF5O14894 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TM4SF5O14894 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TM4SF5O14894 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms