Protein–RNA interactions for Protein: O14777

NDC80, Kinetochore protein NDC80 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDC80O14777 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDC80O14777 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDC80O14777 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
NDC80O14777 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
NDC80O14777 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDC80O14777 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
NDC80O14777 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
NDC80O14777 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDC80O14777 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDC80O14777 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDC80O14777 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
NDC80O14777 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDC80O14777 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDC80O14777 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NDC80O14777 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDC80O14777 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NDC80O14777 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NDC80O14777 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NDC80O14777 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NDC80O14777 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NDC80O14777 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDC80O14777 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDC80O14777 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDC80O14777 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NDC80O14777 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NDC80O14777 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NDC80O14777 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NDC80O14777 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NDC80O14777 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NDC80O14777 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NDC80O14777 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NDC80O14777 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NDC80O14777 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDC80O14777 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
NDC80O14777 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
NDC80O14777 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
NDC80O14777 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
NDC80O14777 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NDC80O14777 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NDC80O14777 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NDC80O14777 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NDC80O14777 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDC80O14777 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDC80O14777 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDC80O14777 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NDC80O14777 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDC80O14777 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NDC80O14777 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NDC80O14777 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NDC80O14777 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NDC80O14777 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NDC80O14777 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDC80O14777 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NDC80O14777 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NDC80O14777 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDC80O14777 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDC80O14777 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDC80O14777 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
NDC80O14777 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NDC80O14777 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
NDC80O14777 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDC80O14777 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NDC80O14777 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
NDC80O14777 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDC80O14777 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NDC80O14777 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDC80O14777 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDC80O14777 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDC80O14777 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NDC80O14777 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NDC80O14777 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NDC80O14777 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NDC80O14777 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDC80O14777 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NDC80O14777 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDC80O14777 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDC80O14777 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDC80O14777 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDC80O14777 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NDC80O14777 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDC80O14777 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDC80O14777 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDC80O14777 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
NDC80O14777 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDC80O14777 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDC80O14777 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDC80O14777 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NDC80O14777 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDC80O14777 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDC80O14777 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDC80O14777 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDC80O14777 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NDC80O14777 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NDC80O14777 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms