Protein–RNA interactions for Protein: O14649

KCNK3, Potassium channel subfamily K member 3, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNK3O14649 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
KCNK3O14649 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
KCNK3O14649 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KCNK3O14649 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
KCNK3O14649 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
KCNK3O14649 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
KCNK3O14649 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
KCNK3O14649 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.56■■■□□ 2
KCNK3O14649 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KCNK3O14649 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
KCNK3O14649 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KCNK3O14649 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
KCNK3O14649 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
KCNK3O14649 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
KCNK3O14649 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms