Protein–RNA interactions for Protein: O14544

SOCS6, Suppressor of cytokine signaling 6, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS6O14544 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOCS6O14544 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SOCS6O14544 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SOCS6O14544 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SOCS6O14544 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SOCS6O14544 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SOCS6O14544 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 229.6 ms