Protein–RNA interactions for Protein: O09167

Rpl21, 60S ribosomal protein L21, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl21O09167 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rpl21O09167 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl21O09167 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl21O09167 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl21O09167 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rpl21O09167 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rpl21O09167 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rpl21O09167 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rpl21O09167 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rpl21O09167 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rpl21O09167 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Rpl21O09167 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl21O09167 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms