Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mesp2O08574 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mesp2O08574 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mesp2O08574 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Mesp2O08574 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mesp2O08574 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms