Protein–RNA interactions for Protein: O00303

EIF3F, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3FO00303 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
EIF3FO00303 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
EIF3FO00303 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
EIF3FO00303 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
EIF3FO00303 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EIF3FO00303 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EIF3FO00303 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms