Protein–RNA interactions for Protein: O00268

TAF4, Transcription initiation factor TFIID subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4O00268 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TAF4O00268 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4O00268 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TAF4O00268 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4O00268 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TAF4O00268 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4O00268 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4O00268 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4O00268 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TAF4O00268 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4O00268 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TAF4O00268 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TAF4O00268 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TAF4O00268 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF4O00268 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TAF4O00268 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF4O00268 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF4O00268 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF4O00268 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TAF4O00268 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF4O00268 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TAF4O00268 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TAF4O00268 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF4O00268 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF4O00268 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF4O00268 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TAF4O00268 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF4O00268 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TAF4O00268 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF4O00268 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TAF4O00268 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TAF4O00268 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF4O00268 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TAF4O00268 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF4O00268 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF4O00268 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TAF4O00268 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF4O00268 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF4O00268 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF4O00268 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TAF4O00268 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TAF4O00268 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF4O00268 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF4O00268 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TAF4O00268 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF4O00268 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF4O00268 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF4O00268 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF4O00268 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TAF4O00268 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF4O00268 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF4O00268 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF4O00268 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF4O00268 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TAF4O00268 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TAF4O00268 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF4O00268 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF4O00268 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF4O00268 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TAF4O00268 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF4O00268 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TAF4O00268 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF4O00268 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF4O00268 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TAF4O00268 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF4O00268 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF4O00268 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF4O00268 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TAF4O00268 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF4O00268 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF4O00268 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TAF4O00268 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF4O00268 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF4O00268 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TAF4O00268 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF4O00268 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TAF4O00268 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF4O00268 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TAF4O00268 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF4O00268 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF4O00268 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TAF4O00268 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms