Protein–RNA interactions for Protein: O00232

PSMD12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD12O00232 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PSMD12O00232 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PSMD12O00232 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PSMD12O00232 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PSMD12O00232 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PSMD12O00232 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PSMD12O00232 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms